iDeCoの年末調整・確定申告ガイド｜書き方と「いくら戻る」の目安

iDeCoの税申告は年末調整 or 確定申告

iDeCoの掛金は「小規模企業共済等掛金控除」として所得控除の対象です。ただし、申告しないと控除は適用されません。忘れると節税メリットを受けられなくなるので注意しましょう。

あなたはどちら？判定フロー

あなたの状況	申告方法
会社員・公務員（個人払込）	年末調整
会社員・公務員（事業主払込＝給与天引き）	申告不要（自動で控除）
自営業・フリーランス	確定申告
年の途中で転職した	確定申告
年末調整に間に合わなかった	確定申告

事業主払込（給与天引き）の場合、掛金は給与から天引きされる時点で所得控除に反映されるため、自分での申告手続きは不要です。

年末調整での申告方法

Step 1: 払込証明書を確認する

毎年10月〜11月頃に、国民年金基金連合会から「小規模企業共済等掛金払込証明書」が届きます。

証明書のチェックポイント:

• 「合計金額」欄: その年に実際に払い込んだ掛金の合計（1月〜9月分）
• 「見込額を含む合計金額」欄: 12月分までを含めた年間合計 → この金額を申告書に記入

10月以降にiDeCoを開始した場合、払込証明書の届く時期が翌年1月頃になることがあります。その場合は年末調整に間に合わないため、確定申告で対応しましょう。

Step 2: 申告書に記入する

会社から配布される「給与所得者の保険料控除申告書」の以下の欄に記入します。

記入欄: 「小規模企業共済等掛金控除」の「確定拠出年金法に規定する個人型年金加入者掛金」

記入する金額: 払込証明書の「見込額を含む合計金額」

記入はこの1か所だけです。生命保険料控除のように複雑な計算は不要で、掛金の全額がそのまま控除額になります。

Step 3: 証明書を添付して提出

払込証明書を申告書に添付（または貼付）して、勤務先に提出すれば完了です。

確定申告での申告方法

自営業の方や、年末調整に間に合わなかった方は確定申告で控除を受けます。

確定申告書への記入箇所

確定申告書の「所得から差し引かれる金額」欄にある「小規模企業共済等掛金控除」に、年間の掛金合計額を記入します。

e-Taxの場合

1. 「所得控除の入力」画面で「小規模企業共済等掛金控除」を選択
2. 「個人型確定拠出年金（iDeCo）」の欄に年間掛金額を入力
3. 払込証明書のデータ（XMLファイル）を読み込むことも可能

e-Taxで電子申告する場合、払込証明書の原本提出は不要です。ただし、5年間の保管義務があります。

「いくら戻る？」還付額の目安

年末調整や確定申告でiDeCoの控除を申告すると、払い過ぎた所得税が還付されます。住民税は翌年度の税額から減額されます。

会社員（企業年金なし）月23,000円拠出の場合

課税所得	所得税の還付（目安）	住民税の減額（目安）	年間合計（目安）
195万円以下	約13,800円	約27,600円	約41,400円
195〜330万円	約27,600円	約27,600円	約55,200円
330〜695万円	約55,200円	約27,600円	約82,800円
695〜900万円	約63,480円	約27,600円	約91,080円

※ 年間掛金276,000円で計算。復興特別所得税・各種控除等は含まない簡易計算です。

所得税の還付は年末調整なら12月〜1月の給与に上乗せ、確定申告なら申告後1〜2か月で指定口座に振り込まれます。住民税の減額は翌年6月からの住民税に反映されます。

よくあるミス・注意点

1. 払込証明書を紛失した

国民年金基金連合会に再発行を依頼できます。再発行には2〜3週間かかるので、早めに手続きしましょう。

2. 年末調整に間に合わなかった

確定申告で取り戻せます。翌年の1月1日から5年以内であれば「還付申告」として申告可能です。年末調整をやり直す必要はありません。

3. 掛金を年の途中で変更した

払込証明書には変更後の金額も含めた「見込額を含む合計金額」が記載されます。この金額をそのまま使えばOKです。

4. 転職して掛金の払込が一時中断した

中断期間分の掛金は発生しないため、実際に払い込んだ分だけが控除の対象です。払込証明書に記載された金額を使いましょう。

5. iDeCoの事業主払込と個人払込の違い

• 事業主払込（給与天引き）: 自動で控除されるため申告不要
• 個人払込（口座引落し）: 年末調整または確定申告で申告が必要

どちらの方法で払い込んでいるかは、毎月の給与明細で確認できます。

まとめ

• iDeCoの控除は申告しないと適用されない（事業主払込を除く）
• 会社員は年末調整、自営業は確定申告で申告
• 払込証明書の「見込額を含む合計金額」を記入するだけ
• 年末調整に間に合わなくても確定申告で取り戻せる
• 還付額は課税所得が高いほど大きい

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※ 本記事の内容は2026年2月時点の制度に基づいています。税制・様式は変更される可能性があります。実際の申告にあたっては、最新の公的情報や税務署の案内をご確認ください。